Cacing tanah Lumbricus rubellus (Red Word) sejak zaman dahulu banyak digunakan sebagai obat tradisional untuk mengobati stroke. Lumbrokinase yang diproduksi oleh cacing tanah spesies L. rubellus memiliki aktifitas fibrinolitik. Lumbrokinase terbagi menjadi enam kelompok, yaitu F-III-2, F-III-1, F-II, F-I-2, F-I-1, and F-I-0. Enzim yang memiliki aktivitas fibrinolitik dengan aktivitas mirip protease serin, yaitu kelompok F-III. Adapun karakterisitik dari enzim ini, yaitu stabil pada suhu 60 derajat C dan memiliki rentang pH antara 2 dan 11.
Cacing tanah spesies L. rubellus sangat bermanfaat bagi manusia. Namun perlu diperhatikan pula, jumlah produksi lumbrokinase dari setiap ekor cacing tanah sangat terbatas, sehingga diperlukan teknik khusus untuk meningkatkan jumlah produksi lumbrokinase, seperti teknik DNA rekombinan.
Tujuan dari penelitian ini, adalah untuk mengisolasi gen lumbrokinase dari L. rubellus galur lokal untuk ditentukan urutan nukleotidanya. Dalam penelitian ini, telah diisolasi RNA total, mRNA, dan DNA kromosom dari L rubellus galur lokal. Kemudian, DNA dan RNA yang dihasilkan digunakan sebagai templat dalam proses PCR dan RT-PCR sehingga dapat dihasilkan DNA dan cDNA yang mengode gen lumbrokinase.
Primer yang digunakan merupakan hasil perancangan dengan menggunakan urutan nukleotida yang telah dipublikasikan dengan nomor akses AF304199, ABO45719, dan ABO45720 yang diperoleh dari Gene Bank. Program yang digunakan pada perancangan primer, yaitu Clustal X, DNA Star, dan Gene Doc program Primer Select serta Edit Seq.
Proses amplifikasi menggunakan metode PCR dan RT-PCR menghasilkan fragmen DNA berukuran sekitar 300 pb. Hasil produk amplifikasi yang diharapkan, yaitu sekitar 500 sampai 800 pb. Elektroforegram urutan nukleotida menunjukkan bahwa produk PCR merupakan campuran fragmen DNA. Hasil ini menunjukkan bahwa rancangan primer tidak menempel secara spesifik pada gen target lumbrokinase. Pada masa yang akan datang, sangat diperlukan perancangan degenerate primer berdasarkan residu asam amino dari lumbrokinase yang diperoleh dari L. rubellus galur lokal.
Perpustakaan Digital ITB