Masjid merupakan sebuah bangunan peribadatan yang memiliki arti sajada atau sujud dan beribadah kepada-Nya. Pada zaman Rasulullah SAW, masjid bukan hanya menjadi tempat untuk shalat namun memainkan berbagai peran dan fungsi yang luas dalam pembinaan umat, begitu pula pada masjid yang berlokasi di Cibinong Science Center, LIPI. Proyek re-desain masjid eksisting CSC-LIPI menjadi Masjid Al-Muzdahir CSC-LIPI memiliki berbagai peran dan fungsi dalam memenuhi kebutuhan penunjang dari dalam maupun lingkungan sekitar kawasan. Bangunan terdiri atas 3 zona besar yang disatukan oleh ruang bersama dan menara. Zona tersebut yaitu zona masjid, RSG dan pengelola. Isu proyek berfokus kepada kekhasan lokasi yang merupakan sebuah kawasan ilmu pengetahuan dan penelitian ilmu hayati. Dengan lahan yang terletak di depan gerbang CSC-LIPI, diharapkan bangunan memiliki kekhasan proyek yaitu sebagai wajah dari CSC-LIPI itu sendiri. Dengan konsep masjid kontemporer yang memberikan nuansa spiritual melalui kekayaan botani, bangunan masjid secara utuh dapat mencerminkan sebuah kemajuan dan memberikan pengalaman spiritual secara langsung mengenai ilmu pengetahuan hayati. Bangunan dirancang tepat guna dengan penggunaan berbagai macam tanaman, contohnya pada dinding mihrab yang menggunakan tanaman bunga rambat air, dan penggunaan tanaman rambat pada fasad keseluruhan bangunan utama. Bangunan arsitektur islami ini diharapkan dapat memperlihatkan bukti-bukti akan kebesaran Allah SWT dalam keselarasan, keseimbangan, dan keindahan dalam desain.