Sungai Cileungsi merupakan Sub-DAS yang termasuk pada WS CiliwungCisadane dengan bagian hilir berada pada perbatasan Kabupaten Bogor dan Kota
Bekasi. Secara admministratif, Sub-DAS ini mencakup tujuh wilayah kecamatan
meliputi Kecamatan Gunungputri, Cileungsi, Klapanunggal, Bantargebang,
Jatiasih, Mustikajaya dan Rawa Lumbu. Berdasarkan 6 titik pemantauan dari total
panjang pada Sungai Cileungsi Hilir adalah 35,05 km, status mutu air sungai
berdasarkan metode IP (Indeks Pencemar) menunjukkan bahwa Sungai Cileungsi
Hilir tercemar sedang dengan nilai IP rata-rata adalah 5,13. Berdasarkan hasil
identifikasi daya tampung beban pencemar melalui model WASP, Sungai Cileungsi
menunjukkan bahwa telah melampaui batas daya tampungnya terhadap beban
pencemar meliputi dari domestik, industri, anak sungai, pertanian dan peternakan
dengan total keseluruhan beban pencemar dari semua segmen untuk parameter
BOD adalah 32851,65 kg/hari. Jika dibandingkan dengan baku mutu air sungai
kelas II pada PP Nomor 22 Tahun 2021, Sungai Cileungsi telah melampaui daya
tampungnya dengan beban berlebih sebanyak 21785,6 kg/hari. Berdasarkan hasil
simulasi skenario model dengan pengurangan beban pencemaran dari industri
sebanyak 87%, outlet danau 90%, domestik 60% dan pertanian 20% kualitas Sungai
Cileungsi Hilir dapat memenuhi baku mutu sungai kelas II.