Flavanoid merupakan salah satu senyawa kimia yang terdapat pada
tanaman.Isoflavon (1,2-diarilpropan) merupakan kelompok terbesar dalam
flavanoidyang dapat digunakan untuk penelitian aktivitas antikanker, dimana
salah satu protein target yang diinhibisi Estrogen Receptor Alpha 1 (ESR1) kode
(PDB :2IOK). Tujuan Penelitian adalah mendesain senyawa baru yang memiliki
aktivitas anti kanker, khususnya untuk kanker payudara berdasarkan evaluasi
afinitas senyawa terhadap Estrogen Receptor Alpha(ESR1) dari sel kanker pada
protein 2IOK dengan metode komputasi. Senyawa uji yang digunakan struktur
induk dari isoflavon yang telah dilaporkan memiliki aktivitas antikanker. Dari
hasil validasi metode docking dengan beberapa kombinasi, maka metode terbaik
merupakan kombinasi Triangle matcher-Affinity dG dengan nilai RMSD 1,0452.
Grafik ROC model tersebut memberikan nilai 0,863.Sehingga metode tersebut
digunakan untuk menyaring senyawa-senyawa yang terdapat pada database
senyawa di UI. Hasilnya di dapatkan tiga senyawa yang berpotensi aktif
mempunyai aktivitas terhadap Estrogen Receptor Alpha (ESR1), yaitu
C00010051, C00026048, C00025295.Hasil MD kompleks protein dengan
senyawa tersebut menunjukkan bahwa interaksi antara ligan dengan residu
Phe404 hilang, dan terbentuk ikatan hidrogen dengan residu Glu353. Pada
interaksi senyawa C00025295 dengan reseptor terbentuk ikatan hidrogen dengan
residu Leu346.