Sintesis biodiesel yaitu dengan melalui reaksi transesterifikasi antara trigliserida dengan alkohol.
Reaksi ini dapat dikatalisis oleh enzim lipase, namun dibutuhkan enzim yang termostabil karena reaksi ini berlangsung pada suhu cukup tinggi. Bacillus sonorensis sp yang diisolasi dari pembuatan kompos pada fasa termofil dapat menjadi sumber enzim lipase termostabil. Penelitian
diawali dengan peremajaan kultur B. sonorensis dan produksi enzim lipase. Ekstrak kasar enzim difraksinasi dengan aseton pada 3 tahap : 0-30%, 30-50% dan 50-70%. Hasil uji aktivitas enzim dengan metoda pnp-p palmitat dan uji kadar protein memberikan nilai aktivitas spesifik paling tinggi pada fraksi 30-50% yaitu 92.8 U/mg protein. Dilakukan karakterisasi pH dan temperatur optimum dari fraksi ini. Kondisi optimum enzim yaitu pada pH 7 dan 9, dan temperatur reaksi 60oC. Hasil Native-PAGE dan zymogram menunjukkan terdapat dua pita protein aktif lipase. Transesterifikasi dilakukan dengan trioleat dan metanol. Karakterisasi biodiesel dengan ESI-MS terdapat puncak metil oleat yang menunjukan enzim memiliki aktivitas transesterifikasi. Enzim ini diperkirakan memiliki sifat regioselektif pada ikatan ester di atom karbon 1,3 atau 2,3 dari trigliserida dan nilai efisiensi sekitar 83% dengan 0.56 (Mu)g/mL substrat yang dikonversi menjadi produk setiap jamnya.