Perpustakaan Digital ITB

Selulase merupakan enzim hidrolitik yang mampu mendegradasi selulosa menjadi gula sederhana yaitu glukosa atau oligoselubiosa. Selulase saat ini telah banyak digunakan di dalam campuran pakan ternak, industri tekstil, industri kertas dan lainnya. Pada penelitian sebelumnya telah dilakukan penapisan, isolasi, dan karakterisasi bakteri laut penghasil selulase. Berdasarkan uji mikrobiologi bakteri tersebut telah diidentifikasikan sebagai Bacillus amyloliquefaciens PSM 3.1. Adapun tujuan dari penelitian ini adalah mengisolasi dan mengklon gen pengode endoglukanase dari bakteri laut Bacillus amyloliquefaciens PSM 3.1. Hasil kloning diperoleh gen endoglukanase II (egII) -selulase yang memotong rantai selulosa di bagian dalam- yang berukuran 1500 bp. Gen egII memiliki tingkat kemiripan sebesar 97% dengan gen endoglukanase B. amyloliquefaciens strain UMAS1002 (GenBank No.AF363635.1) dan endoglukanase dari B. subtilis DLG (GenBank No.16185.1B). Analisis in-silico menunjukkan bahwa endoglukanase II yang diekspresikan oleh egII ini dibentuk oleh 2 domain, yaitu domain katalitik dan domain pengikat substrat. Domain katalitik tergolong dalam keluarga glikosil hidrolase 5 (GH 5), dengan residu katalitiknya diprediksi terletak pada residu Glu169 (berperan sebagai donor proton) dan Glu257 (berperan sebagai nukleofil). Sementara itu, domain pengikat substrat termasuk dalam golongan pengikat substrat (CBM) 3, dimana residu-residu yang diprediksi berperan dalam pengikatan substrat adalah Asn13, Asp52, dan Tyr53.