Perpustakaan Digital ITB

Pada penelitian ini ditinjau model Peyrard-Bishop-Dauxois yang dimodifikasi dengan menambahkan potensial tangent hyperbolic pada Hamiltonian sistem, sebagai representasi fisis dari kekentalan pada solvent, serta memperhitungkan gaya gesek dan gaya acak dalam persamaan gerak, sebagai fisis interaksi DNA dengan solvent. Persamaan gerak yang diperoleh diubah menjadi persamaan diferensial stokastik yang digunakan untuk membentuk persamaan diferensial stokastik lainnya, yang dibentuk dengan Kalkulus Ito, dari Hamiltonian hasil rescaling. Persamaan diferensial stokastik dari Hamiltonian ini dirata – ratakan secara stokastik (stochastic averaging) serta ditransformasikan menjadi persamaan Fokker-Planck, yang kemudian direduksi, untuk memberikan fungsi rapat peluang energi rata – rata sistem. Fungsi rapat peluang energi rata – rata sistem yang diperoleh ditinjau pada kasus khusus untuk dibandingkan hasilnya dengan model Peyrard-Bishop-Dauxois. Hasil perbandingan yang diperoleh menunjukkan solvent mengurangi kemungkinan DNA berada pada nilai energi minimum sistem DNA untuk berdenaturasi.