digilib@itb.ac.id +62 812 2508 8800

ABSTRAK Retno Dewi Purnawati
PUBLIC Yati Rochayati

COVER Retno Dewi Purnawati
PUBLIC Yati Rochayati

BAB 1 Retno Dewi Purnawati
PUBLIC Yati Rochayati

BAB 2 Retno Dewi Purnawati
PUBLIC Yati Rochayati

BAB 3 Retno Dewi Purnawati
PUBLIC Yati Rochayati

BAB 4 Retno Dewi Purnawati
PUBLIC Yati Rochayati

BAB 5 Retno Dewi Purnawati
PUBLIC Yati Rochayati

PUSTAKA Retno Dewi Purnawati
PUBLIC Yati Rochayati

HER2 adalah resptor membran yang berfungsi sebagai transmiter sinyal. Ekspresi berlebih reseptor HER2 ditemukan pada 20-30% kanker payudara. Penanganan kanker payudara akibat HER2 dapat dilakukan dengan pemberian antibodi trastuzumab. Melalui penelitian ini ingin diketahui pengaruh yang diberikan oleh trastuzumab pada strukur, dinamika, dan kestabilan monomer HER2 pada membran. Penelitian dilakukan melalui simulasi dinamika molekuler dengan metode pemodelan residue-based coarsegrained (RBCG) dan medan gaya MARTINI. Terdapat dua sistem yang ditinjau yaitu sistem lipid-HER2 dan sistem lipid-HER2-trastuzumab. Setelah ekuilibrasi kedua sistem selama 20 ns, struktur domain ekstraseluler dengan trastuzumab lebih mengalami sedikit perubahan dibanding tanpa adanya trastuzumab. Adanya trastuzumab juga lebih menarik domain transmembran untuk bergerak lebih mendekati domain ekstraseluler. Selain itu, pengaruh trastuzumab juga ditinjau dari perhitungan energi bebas dengan metode FEP. Diperoleh hasil bahwa trastuzumab dapat meningkatkan kestabilan monomer HER2.