COVER Lydia Husen Kartadinata
Terbatas  yana mulyana
» Gedung UPT Perpustakaan
Terbatas  yana mulyana
» Gedung UPT Perpustakaan
BAB 1 Lydia Husen Kartadinata
Terbatas  yana mulyana
» Gedung UPT Perpustakaan
Terbatas  yana mulyana
» Gedung UPT Perpustakaan
BAB 2 Lydia Husen Kartadinata
Terbatas  yana mulyana
» Gedung UPT Perpustakaan
Terbatas  yana mulyana
» Gedung UPT Perpustakaan
BAB 3 Lydia Husen Kartadinata
Terbatas  yana mulyana
» Gedung UPT Perpustakaan
Terbatas  yana mulyana
» Gedung UPT Perpustakaan
BAB 4 Lydia Husen Kartadinata
Terbatas  yana mulyana
» Gedung UPT Perpustakaan
Terbatas  yana mulyana
» Gedung UPT Perpustakaan
BAB 5 Lydia Husen Kartadinata
Terbatas  yana mulyana
» Gedung UPT Perpustakaan
Terbatas  yana mulyana
» Gedung UPT Perpustakaan
BAB 6 Lydia Husen Kartadinata
Terbatas  yana mulyana
» Gedung UPT Perpustakaan
Terbatas  yana mulyana
» Gedung UPT Perpustakaan
PUSTAKA Lydia Husen Kartadinata
Terbatas  yana mulyana
» Gedung UPT Perpustakaan
Terbatas  yana mulyana
» Gedung UPT Perpustakaan
Superoksida dismutase dari Citrus limon (SOD_Cl) merupakan metaloprotein dengan Cu dan Zn
sebagai logam kofaktornya (Cu/ZnSOD). Aktivitas SOD_Cl sebagai protein antioksidan yang stabil
pada pH asam dan protease kimotripsin dan tripsin menjadikannya kandidat protein terapeutik oral
maupun topikal. Struktur tiga dimensi SOD_Cl diperlukan untuk mempelajari struktur dan
mekanismenya sebagai SOD yang tahan asam. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan
pemeriksaan aktivitas dan karakterisasi molekul SOD_Cl serta mengetahui karakteristik SOD_Cl
berdasarkan kajian struktur in silico dan bioinformatik. Overproduksi SOD_Cl dilakukan dengan
mengekspresikan protein pada Escherichia coli BL21(DE3). Penambahan fragmen polihistidin pada
ujung amino SOD_Cl memungkinkan dilakukannya purifikasi menggunakan kromatografi kolom
afinitas Ni2+ -NTA. Uji aktivitas dengan metode zimografi menunjukkan aktivitas SOD_Cl dalam LEW
yang mengandung imidazol lebih rendah daripada dalam Tris-HCl dan LEW. Karakterisasi dimensi
molekul SOD_Cl dalam dapar fosfat pH 6, 7, dan 8 menggunakan dynamic light scattering
menunjukkan kecenderungan agregasi protein karena besarnya nilai dimensi molekul yang
diberikan. Pemodelan struktur SOD_Cl dilakukan menggunakan Swiss-Model berdasarkan template
struktur protein dengan identitas tertinggi 83,55%, yaitu Cu/ZnSOD Potentilla atrosanguinea (PDB
ID: 2q2l). Model struktur SOD_Cl memberikan nilai GMQE 0,95 dan QMEAN 0,11, mengindikasikan
pemilihan template sudah tepat. Validasi dengan MolProbity menunjukkan bahwa model struktur
SOD_Cl yang dihasilkan dapat digunakan. Berdasarkan analisis hubungan struktur-fungsi, ciri
struktural dan karakteristik Cu/ZnSOD umum dapat ditemukan pada SOD_Cl antara lain adanya
situs aktif pengikatan logam kofaktor yang melibatkan loop elektrostatik.