Perpustakaan Digital ITB

Tesis ini mengkaji tentang konstruksi serta pemanfaatan ruang vektor dan aljabar Lie kode genetik. Kode genetik merupakan seperangkat instruksi pada gen yang menyatakan asam amino. Setiap kode genetik tersusun oleh 3 dari 4 basa nukleotida Deoxyribonucleic Acid (DNA) atau Ribonucleic Acid (RNA). Basa nukleotida DNA tersebut adalah Adenin (A), Guanin (G), Sitosin (C) dan Timin (T). Sedangkan pada RNA, basa Timin (T) berganti menjadi Urasil (U). Pengkajian difokuskan pada himpunan basa RNA karena RNA merupakan salinan DNA dalam proses sintesis protein. Hasil utama pada tesis ini adalah konstruksi ruang vektor kode genetik memas- tikan dapat didenisikannya struktur lain untuk pemanfaatan kajian bidang genetika. Struktur yang dapat dibangun dari ruang vektor kode genetik adalah ruang kuosien kode genetik, aljabar Lie kode genetik dan transformasi linier pada ruang vektor kode genetik. Ruang kuosien mempartisi kode genetik berdasarkan sifat sikokimianya. Hal ini mengkonrmasi bahwa penyusunan tabel kode genetik yang dilakukan pu- luhan tahun lalu tidak dilakukan secara acak. Struktur aljabar Lie membagi himpunan kode genetik menjadi himpunan kolinier. Himpunan kolinier terse- but berkaitan dengan polaritas asam amino pada proses interaksi protein dan rata-rata kontak energi asam amino pada interior protein. Terakhir, transformasi linear pada ruang vektor mere eksikan proses mutasi substitusi pada kode genetik. Kajian lebih lanjut menunjukkan bahwa proses mutasi substitusi dapat dipandang sebagai automorsma diagonal lokal pada ruang vektor kode genetik. Hasil ini ditunjukkan pula dengan hasil trans- formasi pada gen lipase LK ITB5a yang dimutasi dengan Polymerase Chain Reaction (PCR), dimana matriks transformasinya merupakan matriks diagonal dengan determinan tak-nol. Lebih jauh, automorsma diagonal lokal menga- wetkan struktur aljabar Lie pada kode genetik.