Perpustakaan Digital ITB

Protein HER2 merupakan protein reseptor pada sel payudara yang pada keadaan normal bekerja dalam membantu mengontrol bagaimana sel payudara yang sehat tumbuh, membelah, dan memperbaiki dirinya sendiri. Namun pada sekitar 25% kasus kanker payudara, ekspresi berlebih pada protein HER2 memicu terjadinya perkembangan kanker payudara. Di dalam sel, protein tersolvasi oleh air, sehingga pada penelitian ini akan dibahas tentang bagaiman dinamika protein HER2 yang tersolvasi di dalam air serta menganalisis energi bebasnya untuk mengetahui kestabilan protein tersebut saat tersolvasi. Untuk itu digunakanlah simulasi dinamika molekular dengan model medan gaya all-atom. Dengan menggunaan metode all-atom ini, kita dapat mengetahui dinamika protein dengan lebih spesifik karena metode ini memperhitungkan interaksi dari setiap atom yang disimulasikan di dalam program.