Perpustakaan Digital ITB

Abstrak: DnaJ adalah protein chaperone yang membantu proses pelipatan, translokasi, dan degradasi protein. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi gen pengkode DnaJ dari bakteri termofilik Bacillus sp. RP1 dan untuk melakukan studi in silico terhadap produk gen yang dihasilkan. Gen pengkode DnaJ dari Bacillus sp. RP1 telah diisolasi dengan metode Polymerase Chain Reaction (PCR) menggunakan primer DJF 1 dan DJR2 yang dirancang berdasarkan urutan nukleotida dnaJ B. stearothermophilus (Accession number Q45552), menghasilkan fragmen DNA berukuran 1,1 kpb. Analisis urutan nukleotida sebanyak 1053 pb dari fragmen DNA hasil PCR menunjukkan tingkat kesamaan 97persen dengan chaperone putative dari Geobacillus kaustophilus (BA000043.1), serta 86persen dengan operon DnaK dari Bacillus stearothermophilus (X90709.1). Fragmen DNA dnaJtelah diklon ke vektor pGEM-T. Prediksi model struktur DnaJ Bacillus sp. RP1 menunjukkan kemiripan dengan struktur domain-J DnaJ Escherichia coli sedangkan domain cys-rich menunjukkan perbedaan.