Perpustakaan Digital ITB

Penggunaan nanopartikel zinc oxide (ZnO NP) telah mengalami peningkatan yang signifikan dengan berbagai fungsinya, antara lain, sebagai drug-delivery system, biosensor, dan nanomedicine. Namun, ZnO NP berpotensi menimbulkan dampak toksik terhadap sel dan jaringan, seperti produksi reactive oxygen species (ROS) yang berlebihan, kerusakan DNA, dan inflamasi kronis jika tidak digunakan secara optimal. Dampak negatif yang ditimbulkan oleh ZnO NP masih belum secara pasti diketahui dan penelitian mendalam masih terbatas hingga kini. Oleh karena itu, pada penelitian ini dilakukan studi untuk mengetahui pengaruh paparan ZnO NP pada hewan uji. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi efek ZnO NP pada regenerasi sirip kaudal zebrafish (Danio rerio) pada level transkriptomik. Zebrafish diamati pertumbuhan sirip kaudalnya setelah didedahkan selama 30 menit dalam medium E3 1X sebagai kelompok kontrol negatif dan ZnO NP 72.59 ppm (LC50) sebagai kelompok perlakuan, dengan masing-masing kelompok sampel terdiri dari 2 technical replicates. Pengamatan luas permukaan dan panjang pertumbuhan blastema setelah 96 hours post-amputation (hpa) dilakukan menggunakan mikroskop optik dan dianalisis menggunakan Image-J. Sekuensing RNA blastema menggunakan Illumina NextSeq PE150 Sequencing. Pra-pengolahan sekuens RNA total blastema dilakukan dengan FastQC v.11.9 dan Cutadapt v.2.8. Pemetaan dan perhitungan gen dilakukan dengan Rsubread v.2.12.2. Differential expression analysis dilakukan dengan EdgeR (Log2FoldChange>|1|, p-value<0.05). Serta enrichment analysis untuk menelusuri ontologi gen dilakukan dengan DAVID, iDEP, dan REACTOME. Pengamatan visual menunjukkan zebrafish pada kelompok perlakuan dengan ZnO NP memiliki pertumbuhan blastema yang lebih kecil dibandingkan zebrafish pada kelompok kontrol negatif (p<0.05). Hasil analisis ekspresi gen diferensial mengidentifikasi sebanyak 333 gen yang terpengaruh ZnO NP LC50 secara signifikan, dengan 83 gen mengalami peningkatan ekspresi dan 250 gen mengalami penurunan ekspresi. Pemberian ZnO NP LC50 terhadap regenerasi sirip kaudal zebrafish memberikan pengaruh signifikan terhadap proses pengikatan dan transpor ion zinc yang diregulasi oleh gen fthl28, respons imun yang diregulasi gen nlrc11 dan prg4a, serta homeostasis lipid yang diregulasi gen hmgcra, msmo1, dan cyp7a1. Penelitian ini diharapkan menjadi informasi dasar dalam pencarian solusi serta alternatif dalam penggunaan nanopartikel zinc oxide.