Mikroorganisme, terdapat berbagai macam yang dapat menguntungkan dan merugikan bagi manusia. Studi banyak dilakukan terhadap mikroorganisme tersebut agar dapat kita manfaatkan sebaik mungkin maupun mencegah timbulnya kerugian. Diantara banyak jenis mikroorganisme, salah satunya adalah ragi. Sebagai jenis mikroorganisme yang banyak dimanfaatkan oleh manusia, ragi memiliki struktur sel tunggal sederhana yang dapat merepresentasikan banyak proses sel kompleks lainnya dan secara umum memiliki bentuk hampir ellips sehingga lebih mudah dimodelkan untuk diteliti lebih lanjut.
Dalam penelitian ini, sel ragi dimodelkan dengan partikel granular berbentuk lingkaran dengan batasan tampilan dua dimensi. Interaksi antar sel ragi satu sama lain serta dengan medium dimodelkan dengan gaya gravitasi, gaya normal, dan gaya Stokes. Untuk pertumbuhan dan lahirnya individu sel ragi dimodelkan secara stokastik dengan dua tipe kemungkinan yang dilakukan dalam simulasi, merata dan tidak. Dengan model tersebut, simulasi dilakukan dengan menggunakan bahasa pemrograman javascript sebanyak seratus kali untuk masing-masing kemungkinan tumbuh dan lahirnya individu baru sel ragi. Dari hasil simulasi yang didapat, memperlihatkan pertumbuhan jumlah sel ragi dalam koloni memiliki perilaku yang sesuai dengan teori, yaitu tumbuh secara eksponensial, begitu juga dengan pertumbuhan ukuran jari-jari koloni yang mana laju pertumbuhannya berbanding terbalik sebanyak dua kali dari laju pertumbuhan jumlah sel nya. Selain itu, perilaku distribusi normal juga terlihat dari hasil simulasi terhadap distribusi ukuran sel ragi pada dua kondisi kemungkinan yang dilakukan. Dari data hasil distribusi posisi dengan ukuran sel ragi dan posisi pusat massa koloni ragi memperlihatkan kecenderungan yang sama dengan parameter kemungkinan yang diberikan dalam simulasi.