Struktur geologi yang terbentuk pada daerah penelitian adalah lipatan, sesar naik, dan sesar geser. Lipatan besar yang terbentuk adalah Antiklin Cisonggom serta Sinklin Walat dengan sumbu yang relatif berarah barat-timur. Sesar naik diinterpretasikan dari rekonstruksi penampang geologi, yang terlihat dari posisi Satuan Batupasir yang berumur lebih tua berada relatif di atas Satuan Batulanau-Batulempung. Sesar geser mengiri yang terbentuk adalah Sesar Bojongkembar yang relatif berarah barat dayatimur laut. Struktur geologi tersebut diperkirakan terbentuk pada Kala Plio-Pleistosen.