Perpustakaan Digital ITB

Foot and mouth disease (FMD) adalah penyakit hewan ternak menular yang paling merugikan secara ekonomi dengan kerugian global mencapai 8-22 miliar USD per tahun. Serotipe O dari Foot and mouth disease virus (FMDV) merupakan varian paling dominan dengan cakupan wilayah Asia dan Afrika. Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan vaksin multi-epitop FMDV serotipe O menggunakan pendekatan Reverse Vaccinology (RV). Sekuens protein struktural FMDV serotipe O (VP1-VP4) dikumpulkan dari database NCBI untuk analisis multiple sequence alignment dalam mengidentifikasi daerah konservatif. Epitop sel B (BCL), epitop sel T penolong (HTL), serta epitop sel T sitotoksik (CTL) diprediksi dari daerah lestari dan diseleksi berdasarkan karakter fisikokimia dan imunogenik. Konstruk vaksin dirancang dengan penggabungan epitop dan penambahan adjuvant Cholera Toxin B (CTB) lalu strukturnya diprediksi pada GalaxyWeb server. Validasi struktur vaksin pada Ramachandran plot menunjukkan mayoritas residu berada pada favorable regions. Analisis molecular docking dari struktur vaksin dengan TLR4 (Toll-like Receptor 4) Bos taurus menunjukkan interaksi yang berlangsung secara spontan. Simulasi Molecular Dynamics (MD) dilakukan untuk mengonfirmasi kestabilan interaksi kompleks vaksin-TLR4 yang telah melalui proses docking. Optimasi kodon dan desain in silico DNA vaksin pada vektor plasmid pET-23a (+) menunjukkan sekuens DNA vaksin dapat diekspresikan dengan optimal oleh bakteri Escherichia coli K12. Vaksin yang dirancang berpotensi sebagai kandidat vaksin FMD serotipe O yang aman dan efektif.