Article Details

ISOLASI, KARAKTERISASI, DAN ANALISIS EKSPRESI GEN MaACS1 DAN MaACO1 SELAMA PROSES PEMATANGAN BUAH PADA PISANG TONGKAT LANGIT (Musa troglodytarum) MENGGUNAKAN RT-PCR

Oleh   KRISTI LENCI PATTY [21113021]
Kontributor / Dosen Pembimbing : Fenny Martha Dwivany, S.Si., M.Si., Ph.D.;
Jenis Koleksi : S2 - Tesis
Penerbit : SITH - Bioteknologi
Fakultas : Sekolah Ilmu dan Teknologi Hayati (SITH)
Subjek :
Kata Kunci : pisang tongkat langit, M. troglodytarum, MaACS1, MaACO1, RT-PCR.
Sumber :
Staf Input/Edit : agus slamet  
File : 1 file
Tanggal Input : 2019-02-08 10:26:07

Generic placeholder image
2016_TS_PP_KRISTI_LENCI_PATTY_1-COVER.pdf

Terbatas
» ITB


Pisang Tongkat Langit (Musa troglodytarum L.) merupakan salah satu jenis kultivar tanaman pisang khas yang hanya terdapat di Indonesia bagian timur yaitu di Maluku, Papua dan penyebarannya sampai ke daerah French Polynesia. Buah pisang tongkat langit (Musa troglodytarum L.) memiliki kandungan ?–karoten yang tinggi dibandingkan kultivar pisang lainnya. ?–karoten berperan sebagai antioksidan dan sebagai senyawa prekusor pro-vitamin A. Ekspresi gen yang mengkodekan ?–karoten berasosiasi dengan pematangan buah ketika mulai terjadi biosintesis etilen. Data-data penelitian sebelumnya menunjukan bahwa gen MaACS1 dan MaACO1 merupakan dua gen yang berperan penting dalam biosintesis etilen pada buah pisang terutama pada M. acuminata. Meskipun demikian isolasi, karakterisasi dan analisi ekspresi gen ACS1 dan ACO1 pada buah pisang tongkat langit (Musa troglodytarum L.) belum pernah dilakukan sehingga informasi mengenai proses pematangan pada buah pisang ini masih sangat minim. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi, mengkarakterisasi dan menganalisis profil ekspresi gen ACS1 dan ACO1 yang berperan dalam proses pematangan buah pisang tongkat langit (Musa troglodytarum L.). Analisis PCR menggunakan primer ACS1 dan ACO1 dari Musa acuminata dilakukan untuk mengindentifikasi gen ACS1 dan ACO1 pada pisang tongkat langit. Hasil isolasi menunjukan fragmen genomik ACS1 berukuran 400 pb dan ACO1 berukuran 500 pb, sedangkan fragmen cDNA ACS1 berukuran 200 pb dan ACO1 berukuran 300 pb. Hasil sekuensing fragmen genomik diblast menggunakan software BLASTN menunjukan bahwa gen ACS1 memiliki homologi yang tinggi dengan gen ACS1 Musa acuminata kultivar ambon lumut yang berukuran 1818 pb (kode akses Gene Bank : GQ396304.1) sedangkan gen ACO1 memiliki homologi tertinggi dengan gen ACO1 Musa acuminata yang berukuran 1593 pb (kode akses Gene Bank : AJ223232.1). Fragmen genomik ACS1 Musa troglodytarum L yang berhasil diisolasi memiliki satu buah intron dan dua buah ekson, sedangkan ACO1 memiliki dua buah intron dan tiga buah ekson. Berdasarkan hasil analisis blast menunjukan bahwa fragmen gen ACS1 dan ACO1 dari buah pisang tongkat langit yang teramplifikasi adalah daerah lestari yang sama dengan Musa acuminata. Analisis ekspresi gen ACS1 dan ACO1 menggunakan RT-PCR (Semi-quantitative reverse transcriptase PCR) menunjukan bahwa ekspresi gen ACS1 meningkat pada hari ke-3 dan mulai mengalami penurunan pada hari ke-5 setelah pasca panen. Sedangkan, ekspresi gen ACO1 pada hari ke-3 mengalami penurunan ekspresi namun pada hari ke-7 mengalami peningkatan ekspresi setelah pasca panen.