Perpustakaan Digital ITB

Tulisan ini memuat representasi probabilistik untuk model Peyrard-Bishop-Dauxois (PBD) yang dimodifikasi pada DNA dengan menambahkan potensial tangent hyperbolic, yang memberikan model potensial yang lebih fisis dari DNA ketika mendeskripsikan mekanisme transkripsi-translasi and juga penambahan langsung dari gaya gesek dan gaya fluktuasi termal pada persamaan gerak dari DNA untuk mendeskripsikan interaksi DNA dengan lingkungannya, yang umumnya adalah air. Berlatar belakang persamaan gerak, Kita dapat mendeskripsikan sistem pada representasi yang berbeda berupa persamaan differensial stokastik (PDS) dan kemudian, dengan mengubah PDS menjadi persamaan Fokker-Planck, memberikan kita bentuk probabilistik berupa fungsi rapat probabilitas transisi untuk suatu bentuk Hamiltonian yang didefinisikan pada awal permasalahan. Bentuk probabilistik yang kita peroleh ini dapat memberikan suatu masukan tertentu tentang apa yang terjadi dengan memodifikasi model PBD dan juga memberitahukan kita apa yang mungkin kita kembangkan lebih lanjut dari hal tersebut.