Perpustakaan Digital ITB

Perkembangan antifungi lebih lambat daripada antibakteri karena sifat sel eukariotik dari jamur yang serupa dengan manusia. Tingkat infeksi jamur juga semakin meningkat pada beberapa tahun terakhir. Toxoplasma gondii menginfeksi sepertiga dari populasi manusia dan dapat memberikan efek membahayakan pada janin dan pasien dengan sistem imun rendah. Namun, obat antitoksoplasmosis yang tersedia saat ini dapat memberikan efek samping yang cukup berat. Oleh karena itu, diperlukan kandidat baru untuk obat antifungi dan antitoksoplasmosis dengan efek samping rendah dan keamanan yang baik. Umbi lapis bawang tiwai diketahui mengandung banyak golongan senyawa naftokuinon yang memiliki aktivitas antifungi dan antiparasit. Studi interaksi secara in silico dilakukan untuk 31 senyawa yang terkandung dalam bawang tiwai dengan protein target alternatif antifungi dan antitoksoplasmosis dengan metode penambatan molekul. Pada penelitian ini, digunakan N-Myristoyltransferase (PDB ID: 1IYL) dan salah satu ORP (oxysterolbinding-protein (OSBP)-related proteins), yaitu Osh4 (PDB ID: 1ZHX) sebagai protein target antifungi serta purin nukleosida fosforilase (PDB ID: 3MB8) dan kalsium-dependen protein kinase-1 (PDB ID: 4M84) sebagai protein target antitoksoplasmosis. Struktur 3D senyawa dibuat dengan Program GaussView 6.0 kemudian dioptimasi dengan Program Gaussian 09W. Protein target dipreparasi dengan Program Discovery Studio. Metode docking divalidasi melalui re-docking ligan awal dengan protein target. Syarat keberterimaan validasi adalah nilai RMSD (root mean square deviation) lebih kecil dari 2 Å. Setelah itu, 31 senyawa tersebut ditambatkan pada protein target dengan Program AutoDock 4.2.6. Prediksi toksisitas akuatik dilakukan pada senyawa kandidat untuk menentukan tingkat keamanannya terhadap organisme air dengan Program ECOSAR V2.0. Hasil penelitian menunjukkan senyawa yang memiliki energi ikatan lebih kecil daripada pembandingnya dengan tingkat toksisitas akuatik yang rendah, secara berturut-turut, untuk protein target antifungi Osh4 dan CaNMT adalah ?-sitosterol dengan energi ikatan -11,55 kkal/mol dan -11,18 kkal/mol, serta untuk protein target antitoksoplasmosis TgPNP dan TgCDPK1 adalah ?-sitosterol dengan energi ikatan sebesar -8,06 kkal/mol dan -10,29 kkal/mol.