Skripsi ini menganalisis varian gen nukleokapsid (N) SARS-CoV-2 pada pasien COVID-19 di Jawa Barat, Indonesia. Penelitian ini bertujuan untuk memahami variasi genetik virus dan kekerabatannya dengan varian global, serta memprediksi perubahan struktur protein akibat mutasi. Sampel swab dari pasien di Jawa Barat dianalisis menggunakan PCR dan sekuensing Sanger. Ditemukan tiga mutasi: R203K/G204R dan A211S pada satu sampel, serta S193I pada sampel lainnya. Mutasi R203K/G204R umum di Indonesia, S193I menduduki urutan ketiga, dan A211S merupakan mutasi baru yang jarang dilaporkan. Analisis filogenetik menunjukkan sampel mengelompok dengan sekuens Indonesia lain yang memiliki mutasi serupa. Protein nukleokapsid dengan mutasi menunjukkan peningkatan struktur beta-strand, yang berpotensi mengurangi fleksibilitas protein. Penelitian ini penting karena pemahaman variasi genetik gen N dapat membantu pengembangan antiviral yang menargetkan pengikatan RNA virus. Penelitian ini dilakukan oleh Irin Annisa Evitayani di Institut Teknologi Bandung (ITB) pada tahun 2021 dan hanya dipergunakan di area kampus ITB untuk keperluan pendidikan dan penelitian.