STUDI EPIDEMIOLOGI MOLEKULER Haemophilus influenzae PADA POPULASI BALITA SEHAT DI KOTABARU, INDONESIA SKRIPSI SARJANA MIKROBIOLOGI Oleh Riana Valentina 10416025 PROGRAM STUDI MIKROBIOLOGI SEKOLAH ILMU DAN TEKNOLOGI HAYATI INSTITUT TEKNOLOGI BANDUNG 2020 2 STUDI EPIDEMIOLOGI MOLEKULER Haemophilus influenzae PADA POPULASI BALITA SEHAT DI KOTABARU, INDONESIA SKRIPSI SARJANA Karya ilmiah sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Sarjana Mikrobiologi (S.Si) dari Institut Teknologi Bandung Oleh Riana Valentina 10416025 PROGRAM STUDI MIKROBIOLOGI SEKOLAH ILMU DAN TEKNOLOGI HAYATI INSTITUT TEKNOLOGI BANDUNG 2020 i HALAMAN PERNYATAAN ORISINALITAS Skripsi ini adalah hasil karya saya sendiri, dan semua sumber baik yang dikutip maupun dirujuk telah saya nyatakan dengan benar. Bilamana di kemudian hari ditemukan bahwa karya tulis ini menyalahi peraturan yang ada berkaitan etika dan kaidah penulisan karya ilmiah yang berlaku, maka saya bersedia dituntut dan diproses sesuai dengan ketentuan yang berlaku. Yang menyatakan, Nama : Riana Valentina NIM : 10416025 Tanda Tangan : Tanggal : 26 Juni 2020 Mengetahui, ii HALAMAN PENGESAHAN TUGAS SARJANA STUDI EPIDEMIOLOGI MOLEKULER Haemophilus influenzae PADA POPULASI BALITA SEHAT DI KOTABARU, INDONESIA Oleh Riana Valentina NIM 10416025 Program Studi Mikrobiologi Sekolah Ilmu dan Teknologi Hayati Institut Teknologi Bandung Diperiksa dan disetujui pada Tanggal: 26 Juni 2020 Pembimbing I Azzania Fibriani, Ph.D NIP.197712052010122002 iii KATA PENGANTAR Puji dan syukur penulis panjatkan kepada Tuhan Yang Maha Esa yang telah memberikan rahmat dan karunia sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi dengan judul “Studi Epidemiologi Molekuler Haemophilus influenzae pada Populasi Balita Sehat di Kotabaru, Indonesia” sebagai salah satu syarat kelulusan Program Studi Sarjana Mikrobiologi pada Sekolah Ilmu dan Teknologi Hayati (SITH), Institut Teknologi Bandung. Penelitian dan penulisan skripsi ini tidak terlepas dari bantuan berbagai pihak, oleh karena itu penulis menyampaikan terima kasih sedalamnya kepada : 1. Keluarga penulis, khususnya Ayah (Harianto Tjahjono) dan Ibu (Ratna Juniawati) sebagai orang tua yang selalu memberikan dukungan dan motivasi dalam proses penelitian Tugas Akhir dan penulisan skripsi. 2. Prof. dr., Amin Soebandrio, Ph. D., Sp.MK., selaku kepala institusi Lembaga Biologi Molekuler Eijkman yang telah memberikan kesempatan bagi penulis untuk dapat terlibat dalam kegiatan penelitian di LBM Eijkman. 3. Ernawati Arifin Giri-Rachman, M.Si., Ph.D., selaku ketua program studi Mikrobiologi ITB yang telah banyak membantu penulis dalam berbagai persiapan (proses administrasi, pembimbingan prosedur Tugas Akhir, dan sebagainya) sehingga penulis dapat melaksanakan penelitian Tugas Akhir di LBM Eijkman dengan baik dan tidak mengalami kesulitan yang berarti. 4. Azzania Fibriani, S.Si., M.Si., Ph.D., selaku pembimbing Tugas Akhir yang telah memberikan banyak waktu, tenaga, pikiran, bimbingan, dan motivasi kepada Penulis selama keberlangsungan penelitian Tugas Akhir di samping melaksanakan kewajiban sebagai garda terdepan dalam penanganan COVID-19 di Indonesia. 5. Dodi Safari, S.Si., Ph.D., selaku pembimbing Tugas Akhir dan kepala Laboratorium Biologi Molekuler LBM Eijkman yang telah memberikan iv kesempatan, bimbingan, arahan, dan motivasi bagi penulis dalam melaksanakan penelitian Tugas Akhir. 6. Miftahuddin Majid Khoeri, S.Si., M.Si., selaku research assistant Laboratorium Bakteriologi Molekuler LBM Eijkman yang memberikan bimbingan dan pengetahuan selama penulis melakukan penelitian di LBM Eijkman. 7. Korrie Salsabila, S.Si., selaku research assistant Laboratorium Bakteriologi Molekuler LBM Eijkman yang telah menjadi kakak dan teman bagi penulis serta memberikan banyak wawasan baru, bimbingan, dan semangat sehingga penulis dapat sampai pada tahap ini. 8. Wisnu Tafroji, S.Si., selaku research assistant Laboratorium Bakteriologi Molekuler LBM Eijkman yang telah banyak membantu penulis ketika penulis mengalami permasalahan selama melakukan penelitian Tugas Akhir. 9. Wisiva Tofriska P., S.Si., selaku research assistant Laboratorium Bakteriologi Molekuler LBM Eijkman yang telah memberikan bimbingan dan dukungan kepada penulis untuk melaksanakan penelitian Tugas Akhir dengan baik. 10. Yayah Winarti, selaku research assistant Laboratorium Bakteriologi Molekuler LBM Eijkman yang telah memberikan dukungan dan motivasi selama berlangsungnya penelitian Tugas Akhir. 11. Hanifah Fajri, selaku research assistant Laboratorium Bakteriologi Molekuler LBM Eijkman, yang telah menjadi kakak bagi penulis serta memberikan motivasi dan nasehat bagi penulis selama menjalankan penelitian Tugas Akhir. 12. Seluruh dosen pengajar di Program Studi Mikrobiologi, SITH ITB maupun dosen di Program Studi lain yang memberikan banyak ilmu. 13. Teman-teman Mikrobiologi angkatan 2016 yang telah memberikan dukungan selama masa perkuliahan di ITB. v Akhir kata, penulis mengharapkan kritik dan saran yang bersifat membangun dan semoga skripsi yang telah disusun ini dapat memberikan manfaat dalam bidang kesehatan maupun ilmu mikrobiologi klinis. Surabaya, 14 April 2020 Penulis vi HALAMAN PERNYATAAN PERSETUJUAN PUBLIKASI TUGAS AKHIR UNTUK KEPENTINGAN AKADEMIS Sebagai sivitas akademik Program Studi Mikrobiologi, Sekolah Ilmu dan Teknologi Hayati Bandung, Institut Teknologi Bandung, saya yang bertanda tangan di bawah ini: Nama : Riana Valentina NIM : 10416025 demi pengembangan ilmu pengetahuan, menyetujui untuk memberikan kepada Sekolah Ilmu dan Teknologi Hayati, Institut Teknologi Bandung, Hak Bebas Royalti Noneksklusif (Non-exclusive Royalti Free Right) atas skripsi saya yang berjudul: Studi Epidemiologi Molekuler Haemophilus influenzae pada Populasi Balita Sehat di Kotabaru, Indonesia Dengan Hak ini Sekolah Ilmu dan Teknologi Hayati berhak menyimpan, mengalihmedia/formatkan, mengelola dalam bentuk pangkalan data (database), merawat, dan mempublikasikan skripsi tugas akhir saya selama tetap mencantumkan nama saya sebagai penulis/pencipta dan sebagai pemilik Hak Cipta. Demikian pernyataan ini saya buat dengan sebenarnya. Dibuat di : Surabaya Pada tanggal : 26 Juni 2020 Yang menyatakan Riana Valentina NIM 10416025 vii ABSTRAK Haemophilus influenzae merupakan patogen oportunis yang dapat menyebabkan berbagai penyakit infeksi pada manusia. H.influenzae serotipe b menjadi penyebab utama dari kasus pneumonia dan meningitis pada anak-anak berusia