Path: Top > S3-Dissertations > Physics-FMIPA > 2018

MODEL HAMILTONIAN DAN PENDEKATAN PATH INTEGRAL DALAM DINAMIKA BIOMOLEKULER DNA DAN MICROTUBULES

HAMILTONIAN MODEL AND PATH INTEGRAL APPROACH ON BIOMOLECULAR DYNAMICS: DNA AND MICROTUBULES CASES.

PhD Theses from JBPTITBPP / 2018-05-17 10:53:07
Oleh : WAHYU HIDAYAT (NIM : 30212012), S3 - Physics-FMIPA
Dibuat : 2018, dengan 8 file

Keyword : path integral, dna, mictotubules, pimc, soliton

Penelitian tentang Dinamika Makromolekul (molecular biology) melibatkan berbagai disiplin ilmu karena ternyata permasalahannya sangat kompleks dan memerlukan berbagai metode baik secara teoretik, eksperimen, maupun komputasi. Penggunaan kaidah ilmu fisika untuk menjawab permasalahan yang masih belum terpecahkan dalam penelitian molecular biology diantaranya: mekanisme transfer energi, perilaku termodinamika pada sistem DNA dan mikrotubulus (microtubules) dimana diteliti pengaruh potensial viskositas. Sistem ditinjau dengan cara memodelkan selengkap mungkin Hamiltonian-nya, lalu dengan pendekatan path-integral diselesaikan besaran fisis terkait yang diperlukan untuk mengetahui apa yang berlaku pada sistem tersebut. Besaran fisis tersebut adalah jarak rata-rata antar pasangan basa pada kasus denaturasi DNA, dan panjang rata-rata microtubules setelah diberi suhu lingkungan. Disini dianalisa bagaimana pengaruh viskositas mengkompensasi dominasi pengaruh suhu yang menyebabkan DNA mudah terdenaturasi, dan pada mikrotubulus pengaruh suhu membuat mikrotubulus mudah terputus atau rusak. Hasil dari disertasi ini juga menunjukan bagaimana viskositas merubah profil energi yang mejalar pada DNA dan mikrotubulus. Khusus pada kasus DNA dihasilkan juga laju rata-rata membelahnya DNA dan sifat termodinamikanya.

Deskripsi Alternatif :

Research on the dynamics of macromolecules (molecular biology) involves an interdisciplinary science form different methods: theoretically, experimentally, and computationally. The application of theoretical physics methods in molecular biology especially in these cases: DNA and Microtubules are still interesting research to study comprehensive. In this dissertation has been investigated the energy transfer mechanism, thermodynamic behavior in the DNA and microtubules system including the effect of viscosity potential. Hamiltonian euqations has been developed to describe both of system, DNA and microtubules, hence by employing path-integral approach to calculate numerically corresponding physical quantities : the average distance of base pairs in the case of DNA denaturation, and the average length of microtubules under biologycal temperature and viscosity. The obtaining results how the effect of viscosity to compensates denaturation of DNA under increasing temperature and to supress microtubules to be easily broken or damaged. In this dissertation also show how the viscosity change the energy profile as long as propagation on DNA and microtubules. Especially in the case of DNA, the speed of DNA splitting are calculated as well as its thermodynamic properties.

Copyrights : Copyright (c) 2001 by Perpustakaan Digital ITB. Verbatim copying and distribution of this entire article is permitted by author in any medium, provided this notice is preserved.

Beri Komentar ?#(0) | Bookmark

PropertiNilai Properti
ID PublisherJBPTITBPP
OrganisasiS3 - Physics-FMIPA
Nama KontakUPT Perpustakaan ITB
AlamatJl. Ganesha 10
KotaBandung
DaerahJawa Barat
NegaraIndonesia
Telepon62-22-2509118, 2500089
Fax62-22-2500089
E-mail Administratordigilib@lib.itb.ac.id
E-mail CKOinfo@lib.itb.ac.id

Print ...

Kontributor...

  • Pembimbing 1 : Prof. Freddy Permana Zen, D.Sc.








    Pembimbing 2 : Dr.rer.nat. Sparisoma Viridi








    Pembimbing 3 : Dr. Albertus Sulaiman, Editor: Alice Diniarti

File PDF...