Path: Top > Member > hidayat@unix.lib.itb.ac.id

Genetic Variability Level Analysis of Aedes aegypti mosquito from Bandung by Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Method

Master Theses from / 2006-08-01 14:32:10
Oleh : Evita Anggrereini (NIM : 206 95509), S2 - Biology
Dibuat : 1998--00-0, dengan 1 file

Keyword :

Random Amplified polymorphic, DNA, Aedes aegypti, Endemic area




Subjek :
Aedes aegypti - Arthropoda - Animals

Kepala Subjek :
Biology

Nomor Panggil (DDC) :
T 595.772 135 ANG

Sumber pengambilan dokumen : Tesis Magister Biologi. Bidang Khusus Biologi Fungsi. (20061593)

Abstrak :

Metoda Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) telah digunakan untuk mengetahui keanekaragaman genetik dari nyamuk Aedes aegypti, sebagai vektor penyakit demam berdarah dengue di Kotamadya Bandung, 3awa Barat. Nyamuk tersebut dikoleksi dan Sukajadi, Padasuka (daerah endenus), Cibiru dan Tamblong (daerah non endemis),berdasarkan data mengenai tingkat serangan demam berdarah dari Dinas Kesehatan Kotamadya Bandung. Enam oligonukleotida digunakan sebagai primer RAPD. Ae. aegypti dari NAMRU (Naval Medical Research Unit, USA I Departemen Kesehatan RI) digunakan untuk pembanding. Analisis kualitatif RAPD menunjukkan bahwa tingkat polimorfisme antara individu nyamuk Ae.aegypti dalam setiap lokasi Sukajadi, Padasuka, Tamblong dan Cibiru 74 %, 80%, 72% dan 66%. Analisis seluruh lank DNA nyamuk Ae.aegypti dari semua lokasi di Bandung mengindikasikan bahwa tingkat polimorfisme DNA Ae.aegypti dan Sukajadi (96.4%), Padasuka (95.3%), Cibiru ( 94.1%) dan Tamblong (94%). Hasil penelitian ini memperlihatkan bahwa primer oligonukleotida OPE 19 membenkan lank DNA yang spesifik untuk nyamuk NAMRU dengan ukuran 760 bp. Total ukuran lank DNA nyamuk yang dapat di amplifikasi berkisar 317 - 26139 bp. Analisis kuantitatif RAPD dengan menggunakan gabungan seluruh primer menunjukkan bahwa nyamuk Ae.aegypti yang berasal dari Bandung (Sukajadi, Padasuka, Tamblong dan Cibiru) membentuk kelompok yang terpisah dari nyamuk NAMRU. Sedangkan Ae.aegypti dari Sukajadi, Padasuka, dan Cibiru tidak menunjukkan suatu pola pengelompokan yang sistematik sehubungan dengan lokasi, nyamuk dan Tamblong membentuk kelompok yang lain dan memperlihatkan indeks kesamaan yang lebih tinggi dan nyamuk lain.

Deskripsi Alternatif :

Abstract :

Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) method has been used to identify the genetic variability of Aedes aegypti, a dengue vector from Bandung, West Java. The mosquitoes were collected from Sukajadi and Padasuka (endemic area), Cibiru and Tamblong (non endemic area), based on the data of dengue risk area from "Dinas Kesehatan Kotamadya Bandung". Six oligonucleotides were used as RAPD's primer. Ae. aegypti from NAMRU (Naval Medical Research Unit, USA/Department of Health RI) was used for comparison. The result of RAPD qualitative analysis showed that the individual polymorphism level of mosquitoes from Sukajadi, Padasuka, Cibiru and Tamblong were 74 %,80%, 72% and 66% respectively. Analysis of all DNA bands based on all areas in Bandung, indicates that polymorphism level of Ae. aegypti from Sukajadi (94.1%) and Padasuka (95.3%) areas were higher than Cibiru (94.1%) and Tamblong (94.0%). The results of these study indicated that oligonucleotides primer of OPE 19 gave a specific band for NAMRU mosquitoes with a size of 760 bp. The total yield of mosquitoes DNA band ranged from 317 to 26139 bp. RAPD quantitative analysis using all primer showed that Bandung mosquitoes formed a separate group from NAMRU mosquito. However Ae. aegypti population from Sukajadi, Padasuka and Cibiru did not showed a systematic grouping pattern and among the sampling area, the Tambiong mosquitoes formed another group and showed a higher similarit index.

Beri Komentar ?#(0) | Bookmark

PropertiNilai Properti
ID Publisher
OrganisasiS
Nama KontakYoka Adam Nugrahaa, S.Sos.
AlamatJl. Ganesha 10
KotaBandung
DaerahJawa Barat
NegaraIndonesia
Telepon022 2500089
Fax62-22-2500089
E-mail Administratordigilib@lib.itb.ac.id
E-mail CKOinfo@lib.itb.ac.id

Print ...

Kontributor...

  • Pembimbing 1 :
    Agus Dana P., Dr.

    Pembimbing 2 :
    Adi Pancoro, Dr.

    Scan :
    Hidayat (2006-08-01)

    , Editor: hidayat@

File PDF...