Path: Top > S1-Final Project > Chemistry-FMIPA > 2017

Studi Polimorfisme Plasmodium falciparum EBA-175 Region IV-V dari Isolat Timika Papua

Polymorphisms study of Plasmodium falciparum EBA-175 Region IV-V from Timika Papua Isolate

Undergraduate Theses from JBPTITBPP / 2017-10-02 13:57:43
Oleh : Melinda (NIM : 10513081), S1 - Chemistry-FMIPA
Dibuat : 2017-10-02, dengan 1 file

Keyword : malaria, vaksin, invasi, EBA-175, polimorfisme

Erythrocyte-Binding Antigen 175 (EBA175) Plasmodium falciparum merupakan salah satu kandidat antigen untuk pengembangan vaksin blood-stage. EBA-175 menjadi kandidat antigen yang penting karena telah diteliti berperan dalam proses invasi Plasmodium dan mempunyai daerah yang dapat berinteraksi dengan Glycophorin A pada eritrosit. Gen EBA-175 terdiri dari beberapa region dimana region I dan VI diketahui tidak memiliki aktivitas binding. Region II sudah banyak diteliti dan diidentifikasi sedangkan region III-V belum jelas. Penelitian menunjukkan bahwa RIII-V membentuk proteksi yang lebih baik daripada RII sehingga dapat menjadi kandidat vaksin yang lebih efektif. Menurut literatur, region IV-V merupakan daerah yang ideal sebagai kandidat antigen untuk vaksin akan tetapi belum ada studi yang dilakukan untuk melihat polimorfisme Plasmodium falciparum RIV-V di Indonesia. Studi ini menjadi studi awal untuk pengembangan vaksin malaria yang efektif dan efisien. Dalam penelitian ini, template DNA EBA-175 diisolasi dari sampel klinis penderita malaria di Timika, Papua. Selanjutnya EBA175 RIII-V (~1600 bp) di PCR kemudian dikloning ke vektor pGEM-T (~3000 bp) dalam Eschericia coli TOP 10F’. Plasmid rekombinan dianalisis restriksi dengan menggunakan enzim PstI. Hasil restriksi diperoleh fragmen dengan ukuran ~4600 bp yang menunjukkan bahwa kloning pGEM-T_EBA-175 telah berhasil dilakukan. Pensejajaran pada 37 hasil sekuensing yang berasal dari 11 sampel menunjukkan adanya mutasi, delesi dan insersi pada beberapa nukleotida sehingga menghasilkan polimorfisme pada gen EBA175 RIV-V yang berasal dari isolat Timika Papua. Daerah yang lestari terdapat pada nukleotida 3429 sampai 3493, 3567 sampai 3623, dan 3792 sampai 3742. Hasil penelitian ini menunjukkan pentingnya studi polimorfisme dalam pengembangan vaksin antimalaria.

Deskripsi Alternatif :

Erythrocyte-Binding Antigen 175 (EBA175) Plasmodium falciparum is one of the antigen candidates for the development of a blood-stage vaccine. EBA-175 becomes an important antigen candidate because it has been studied plays a role in the process of invasion of Plasmodium and has an area that can interact with Glycophorin A in erythrocytes. The EBA-175 gene consists of several regions where regions I and VI are known to have no binding activity. Region II has been widely researched and identified while the region III-V is unclear. Research shows that RIII-V forms better protection than RII so it can be a more effective vaccine candidate. According to the literature, the IV-V region is highly conserved and is an ideal area as an antigen candidate for vaccines but no studies have been done to look at Plasmodium Falciparum RIV-V polymorphisms in Indonesia. This study is a preliminary study for the development of an effective and efficient malaria vaccine. In this study, the EBA-175 DNA template was isolated from a clinical sample of malaria sufferers in Timika, Papua. Furthermore EBA175 RIII-V (~ 1600 bp) in PCR is then cloned to the pGEM-T easy vector (~ 3000 bp) in Eschericia coli TOP 10F '. Recombinant plasmid was analyzed restriction by using PstI enzyme. Restriction results obtained by a fragment of ~ 4600 bp which indicates that cloning pGEM-T_EBA-175 has been successfully performed. Alignment of 37 sequencing results from 11 samples showed mutations, deletions and insertions in some nucleotides resulting in polymorphisms in the EBA175 RIV-V gene originating from the isolate of Timika Papua. Sustainable areas are found in nucleotides 3429 to 3493, 3567 to 3623, and 3792 to 3742. The results of this study indicate the importance of polymorphism studies in the development of antimalarial vaccines.

Copyrights : Copyright (c) 2001 by Perpustakaan Digital ITB. Verbatim copying and distribution of this entire article is permitted by author in any medium, provided this notice is preserved.

Beri Komentar ?#(0) | Bookmark

PropertiNilai Properti
ID PublisherJBPTITBPP
OrganisasiS
Nama KontakUPT Perpustakaan ITB
AlamatJl. Ganesha 10
KotaBandung
DaerahJawa Barat
NegaraIndonesia
Telepon62-22-2509118, 2500089
Fax62-22-2500089
E-mail Administratordigilib@lib.itb.ac.id
E-mail CKOinfo@lib.itb.ac.id

Print ...

Kontributor...

  • Dr. rer. nat. Fifi Fitriyah Masduki, Editor: cecep hikmat

File PDF...