Path: TopS1-Final ProjectMathematics-FMIPA2008

KAJIAN MUTASI mtDNA MELALUI RANTAI MARKOV

Undergraduate Theses from JBPTITBPP / 2017-09-27 11:43:04
Oleh : LIRA ADIYANI (NIM 10104078), Central Library Institute Technology Bandung
Dibuat : 2008, dengan 6 file

Keyword : Mutasi, mtDNA, Rantai Markov

Mutasi mtDNA menjadi salah satu topik menarik yang perlu dibahas. Hal ini dikarenakan beberapa mutasi yang terjadi pada DNA mitokondria seseorang dapat mempengaruhi kesehatan orang tersebut. Dampak yang terjadi berupa penyakit ataupun variasi lain yang memberikan karakteristik individu yang berbeda. Dalam mempelajari mutasi mtDNA, ada dua hal yang menjadi pertanyaan utama, yaitu: (1) "apakah mutasi mtDNA bersifat dependent?" dan (2) "jika ya, bagaimanakah pola yang muncul?".






Metode yang digunakan pada tugas akhir ini mencakup metode uji tanda (sign test) dan rantai Markov. Uji tanda dipakai untuk menguji hipotesis akan ada atau tidaknya trend. Pengujian trend dilakukan sebagai langkah awal untuk mengetahui tingkat korelasi posisi (i-1, i) dan (i, i+1). Selanjutnya, penggunaan rantai Markov dimaksudkan guna melakukan analisis lanjut, yakni mengkuantifikasi pola mutasi mtDNA.






Melalui uji tanda, (i-1, i, i+1) mengindikasikan tidak saling bebas sedangkan dari rantai Markov, basa A, T, C, dan G akan mengalami mutasi jika posisi i+1 diisi oleh basa C (dengan tingkat kecenderungan sebanyak ± 40%), lebih jauh, A, C, dan G akan berubah menjadi T jika posisi i-1 diisi oleh basa A (dengan tingkat kecenderungan sebanyak 54,5%).

Deskripsi Alternatif :

Mutation in mtDNA becomes an interesting topic that we need to discuss. It is caused that if someone has a mutation in his mtDNA, then it might be affect his health. Those effects could be some diseases or another variation that gives different characteristics. In learning mutation, there are two such things become the main problems: (1) does mutation occur dependently? And (2) what is the pattern?






Two methods that are used in this final project are sign test and Markov Chain. Sign test is used for a hypothesis testing to know whether there is a trend or not. The testing is done as a first step to know the correlation between position (i-1, i) and (i, i+1). Furthermore, Markov chain is used for quantifying the pattern of mutation in mtDNA.






From sign test, we can know that position i-1, i, i+1 are dependent. From Markov chain, all nucleotides will mutate if position i+1 is C or cytosine (±40%). Moreover, A, C, and G will mutate (become T) if position i-1 is A or adenine (54.5%).

Copyrights : Copyright Â(c) 2001 by ITB Central Library. Verbatim copying and distribution of this entire article is permitted by author in any medium, provided this notice is preserved.

Beri Komentar ?#(1) | Bookmark

PropertiNilai Properti
ID PublisherJBPTITBPP
OrganisasiC
Nama KontakUPT Perpustakaan ITB
AlamatJl. Ganesha 10
KotaBandung
DaerahJawa Barat
NegaraIndonesia
Telepon62-22-2509118, 2500089
Fax62-22-2500089
E-mail Administratordigilib@lib.itb.ac.id
E-mail CKOinfo@lib.itb.ac.id

Print ...

Kontributor...

  • Pembimbing : Dr. Sutawanir Darwis dan Achmad Saifuddin Noer, Ph.D., Editor: Rizki Apriyanti

File PDF...